يتألف المركز من الأقسام التالية :
- قسم القياس: تطوير وبناءً اختبارات معيارية لقياس مخرجات المؤسسات التعليمية.
- قسم التقويم:إجراء البحوث والدراسات واعداد ونشر الأدلة الإرشادية وبناء قاعدة بيانات خاصة بالقياس والتقويم ونشر ثقافة جودة القياس للجهات العليا (وزارة التعليم العالي –هيئة تخطيط الدولة –رئاسة مجلس الوزراء )
- قسم الدعم العلمي.
- قسم الدعم التقني.